Una de les característiques principals de la gestió del Programa de Dinamització Territorial és la implementació de metodologies transversals amb els professionals, tant de diferentes àrees municipals, d'altres administracions, com d'entitats i associacions, que tenen com a objecte de les seves actuacions la població jove.

Aquest treball transversal es considera un element imprescindible per assolir els objectius del Programa de Dinamització Territorial ja que facilita, per una banda l'apropament dels recursos de Joventut al territori i, per l'altra, el coneixement de la realitat juvenil per part dels tècnics del Programa de Dinamització Territorial per tal de poder adaptar les polítiques de Joventut a aquesta realitat territorial.